Le vendredi 27 mars 2026, Clément DURET présentera l'examen en vue de l’obtention du grade académique de Docteur en Sciences (Collège de doctorat en Biologie des organismes et écologie) sous la direction de Mathieu DENOEL et Osamu KISHIDA.
Cette épreuve consistera en la défense publique d’une dissertation intitulée :
« A giant predator in a warming, fragmented riverscape: gigantism, trophic ecology and conservation threats in the Japanese giant salamander (Andrias japonicus) ».
Le Jury sera composé de :
M. N. MAGAIN (Président), MM. D. COGALNICEANU (Ovidius University of Constanța), M. DENOEL (Promoteur), B. FREDERICH, O. KISHIDA (Hokkaido University) (Co-promoteur), R. MANENTI (Università degli Studi di Milano), L. MICHEL (Secrétaire).
Cette thèse explore le rôle écologique et les menaces pesant sur la salamandre géante du Japon (Andrias japonicus), l’un des plus grands amphibiens au monde et une espèce emblématique des rivières japonaises. En combinant des approches à différentes échelles — modèles de distribution sous changement climatique, analyses de fragmentation des réseaux de rivières par les barrages, et étude de l’écologie trophique par contenus stomacaux et isotopes stables — ce travail examine à la fois la vulnérabilité de l’espèce et son rôle dans le fonctionnement des écosystèmes. Les résultats montrent que la distribution future de l’espèce pourrait fortement se contracter sous l’effet du changement climatique et que la fragmentation des rivières constitue une contrainte majeure pour la connectivité des populations. Parallèlement, la thèse met en évidence le rôle central du gigantisme : au cours de la croissance, les salamandres accèdent à des niveaux trophiques supérieurs et les plus grands individus occupent une position de prédateur dominant, contribuant de manière disproportionnée à la structure et à la complexité des réseaux trophiques. Ce travail propose ainsi une approche intégrative reliant écologie individuelle, structure des communautés et enjeux de conservation dans les écosystèmes fluviaux.
This thesis investigates the ecological role and conservation challenges of the Japanese giant salamander (Andrias japonicus), one of the largest amphibians in the world and an emblematic species of Japanese river ecosystems. By combining approaches across multiple spatial scales—species distribution models under climate change, analyses of river fragmentation by dams, and trophic ecology based on stomach contents and stable isotopes—this work examines both the vulnerability of the species and its ecological role. The results show that suitable habitats may strongly contract under future climate scenarios and that river fragmentation represents a major constraint on population connectivity. At the same time, the thesis highlights the central role of gigantism: as salamanders grow, they access higher trophic levels, and the largest individuals function as dominant predators that disproportionately shape the vertical structure and complexity of riverine food webs. Overall, this work provides an integrative perspective linking individual ecology, community structure, and conservation in freshwater ecosystems.
La thèse est intitulée : « Hijacking of alternative splicing regulatory networks by FET fusion oncoproteins ».
